Метод Холма

Материал из MachineLearning.

(Различия между версиями)
Перейти к: навигация, поиск
(Новая: '''Поправка Бонферрони''' — один из методов контроля групповой вероятности ошибки (первого рода). ...)
Строка 1: Строка 1:
-
'''Поправка Бонферрони''' — один из методов контроля [[FWER|групповой вероятности ошибки]] (первого рода).
+
'''Метод Холма-Бонферрони''' (также '''Метод Холма''', '''Поправка Холма-Бонферрони''') — один из методов контроля [[FWER|групповой вероятности ошибки]] (первого рода). Является равномерно более мощным, чем [[поправка Бонферрони]] и решает проблему падения мощности при росте числа гипотез.
-
 
+
-
'''Метод Холма-Бонферрони''' (также '''Метод Холма''', '''Поправка Холма-Бонферрони''') — один из методов контроля [[FWER|групповой вероятности ошибки]] (первого рода). Является равномерно более мощным, чем [[поправка Бонферрони]] и решает проблему падения мощности при росте числа гипотез.
+
== Определение ==
== Определение ==
-
=== Теоретическое обоснование ===
+
Пусть <tex>p_{(1)}\leq \ldots \leq p_{(m)}</tex> — уровни значимости <tex>p_i</tex>, упорядоченные по неубыванию, <tex>H_{(1)}, \ldots, H_{(m)}</tex> — соответствующие <tex>p_{(i)}</tex> гипотезы. Процедура Холма определена следующим образом.
 +
: Шаг 1. Если <tex>p_{(1)}\geq\frac{\alpha}{m}</tex>, принять гипотезы <tex>H_{(1)}, \ldots, H_{(m)}</tex> и остановиться. Иначе, если <tex>p_{(1)}<\frac{\alpha}{m}</tex>, отвергнуть гипотезу <tex>H_{(1)}</tex> и продолжить проверку оставшихся гипотез на уровне значимости <tex>\alpha/(m-1)</tex>.
 +
: Шаг 2. Если <tex>p_{(2)}\geq\frac{\alpha}{m-1}</tex>, принять гипотезы <tex>H_{(2)}, \ldots, H_{(m)}</tex> и остановиться. Иначе, если <tex>p_{(2)}<\frac{\alpha}{m-1}</tex>, отвергнуть гипотезу <tex>H_{(2)}</tex> и продолжить проверку оставшихся гипотез на уровне значимости <tex>\alpha/(m-2)</tex>.
 +
: И т.д.
 +
Процедура обеспечивает <tex>\operator{FWER}\leq\alpha</tex> при любом характере зависимости между <tex>p_i.</tex>
-
== Замечания ==
+
=== Альтернативная постановка ===
 +
При рассмотрении неравенств, деление может быть заменено на умножение, то есть вместо неравенств вида <tex>p_{(i)}<\frac{\alpha}{m-i+1}</tex> используются неравенства вида <tex>p \cdot (m-i+1)<\alpha</tex>.
== Пример ==
== Пример ==
 +
 +
Рассмотрим проверку 4-х гипотез при <tex>\alpha=0.05</tex>. Пусть для них получены p-value: 0.01, 0.04, 0.03 and 0.005. Будут проверены следующие неравенства:
 +
1. <tex>0.005 \cdot (4 - 1 + 1) < 0.05 \qquad \Rightarrow</tex> отклоняем 4-ю нулевую гипотезу.
 +
2. <tex>0.01 \cdot (4 - 2 + 1) < 0.05 \qquad \Rightarrow</tex> отклоняем 1-ю нулевую гипотезу.
 +
3. <tex>0.03 \cdot (4 - 3 + 1) >= 0.05 \qquad \Rightarrow</tex> принимаем 3-ю и 4-ю нулевую гипотезы.
== Реализации ==
== Реализации ==
Строка 18: Строка 26:
== Ссылки ==
== Ссылки ==
-
* Holm, S. (1979). [http://www.jstor.org/stable/4615733 "A simple sequentially rejective multiple test procedure"]. Scandinavian Journal of Statistics 6 (2): 65–70.
+
* Holm, S. (1979). [http://www.jstor.org/stable/4615733 «A simple sequentially rejective multiple test procedure»]. Scandinavian Journal of Statistics 6 (2): 65-70.
* [http://en.wikipedia.org/wiki/Holm–Bonferroni_method Holm-Bonferroni method]
* [http://en.wikipedia.org/wiki/Holm–Bonferroni_method Holm-Bonferroni method]

Версия 01:00, 28 января 2014

Метод Холма-Бонферрони (также Метод Холма, Поправка Холма-Бонферрони) — один из методов контроля групповой вероятности ошибки (первого рода). Является равномерно более мощным, чем поправка Бонферрони и решает проблему падения мощности при росте числа гипотез.

Содержание

Определение

Пусть p_{(1)}\leq \ldots \leq p_{(m)} — уровни значимости p_i, упорядоченные по неубыванию, H_{(1)}, \ldots, H_{(m)} — соответствующие p_{(i)} гипотезы. Процедура Холма определена следующим образом.

Шаг 1. Если p_{(1)}\geq\frac{\alpha}{m}, принять гипотезы H_{(1)}, \ldots, H_{(m)} и остановиться. Иначе, если p_{(1)}<\frac{\alpha}{m}, отвергнуть гипотезу H_{(1)} и продолжить проверку оставшихся гипотез на уровне значимости \alpha/(m-1).
Шаг 2. Если p_{(2)}\geq\frac{\alpha}{m-1}, принять гипотезы H_{(2)}, \ldots, H_{(m)} и остановиться. Иначе, если p_{(2)}<\frac{\alpha}{m-1}, отвергнуть гипотезу H_{(2)} и продолжить проверку оставшихся гипотез на уровне значимости \alpha/(m-2).
И т.д.

Процедура обеспечивает \operator{FWER}\leq\alpha при любом характере зависимости между p_i.

Альтернативная постановка

При рассмотрении неравенств, деление может быть заменено на умножение, то есть вместо неравенств вида p_{(i)}<\frac{\alpha}{m-i+1} используются неравенства вида p \cdot (m-i+1)<\alpha.

Пример

Рассмотрим проверку 4-х гипотез при \alpha=0.05. Пусть для них получены p-value: 0.01, 0.04, 0.03 and 0.005. Будут проверены следующие неравенства: 

 1. 0.005 \cdot (4 - 1 + 1) < 0.05 \qquad \Rightarrow отклоняем 4-ю нулевую гипотезу.
 2. 0.01 \cdot (4 - 2 + 1) < 0.05 \qquad \Rightarrow отклоняем 1-ю нулевую гипотезу.
 3. 0.03 \cdot (4 - 3 + 1) >= 0.05 \qquad \Rightarrow принимаем 3-ю и 4-ю нулевую гипотезы.

Реализации

  • MATLAB: функция multcompare, вычисляющая поправку Бонферрони, не поддерживает, однако, поправку Холма-Бонферрони. Реализация доступна на MATLAB File Exchange
  • R: функция p.adjust (с параметром method="holm") из стандартного пакета stats позволяет получить модифицированные уровни значимости с учетом поправки Холма-Бонферрони.

Ссылки

См. также

Поправка Бонферрони FWER

Источник — «http://www.recognition.su/wiki/index.php?title=%D0%9C%D0%B5%D1%82%D0%BE%D0%B4_%D0%A5%D0%BE%D0%BB%D0%BC%D0%B0»